南方医科大学把“特色兴校”作为一大战略和生存之本,坚持以办学特色为基本指向,统筹各层次、各专业协调发展。学校移交广东省短短7年,以特有的热情、勇气、力度和实力参加代表国家教学品牌最高水平的“国家教学质量工程”建设,在7个领域实现了零的突破,建成36个国家本科教学质量工程品牌,88个广东省质量工程品牌。现有3个国家级教学团队、7个国家特色专业、8门国家精品课程、3门国家双语示范课程、2个国家实验教学示范中心、1个国家人才培养模式创新实验区、2名国家级教学名师。2009年4年一届的国家教学成果奖评审,一举夺得3项国家优秀教学成果二等奖,获此殊荣的高校全国只有48所。2004年成为全国首批试办八年制医学教育的高校,是获得此项办学资质高校中唯一一所地方独立医科大学。
“全程渗透,多维互动”的本科生创新能力培养模式,被《光明日报》《中国教育报》《解放军报》、CCTV网络频道、中国教育电视台等多家媒体报道;“理工医结合,培养复合型人才”的人才培养模式,开创了医科院校培养理工医复合型人才的先河。这两个办学特色项目均获得国家优秀教学成果二等奖。学校与军队和地方相关单位联合探索形成应急型预防医学人才培养新体系,成为国家应急型预防医学人才培养创新试验区,先后获得国家优秀教学成果二等奖、广东省优秀教学成果一等奖。在“甲流”爆发流行期间,作为教育部指定派出医学生的全国4所医科院校之一,学校派出近百名本科生参加白云机场出入境口岸、珠海出入境口岸承担“甲流”防控任务,学生的专业技能和出色表现得到政府有关部门和新闻媒体的高度赞赏。
靠稳健扎实的内涵建设打造鲜明的办学特色,赢得了社会的广泛赞誉。学校成为国家首批专科医师规范化培训试点单位、首批“卫生部临床药师培训试点基地”、教育部“教育援外基地”、商务部援外培训单位、中国政府奖学金院校、国家职业医师资格临床实践技能考试基地和考官培训单位、广东省开办英语授课临床医学本科留学生教育院校、广东省住院医师规范化培训考试中心、广东省大学生创新实验计划项目建设高校、广东省大学生科技创业孵化基地。学校与世界卫生法学会、中国卫生法学会创办了卫生法学国际研究院,成为中国卫生法学人才培养的高地之一。学校与广东省残疾人联合会共同打造华南康复医学优势品牌,与国防科技大学携手培养八年制临床医学本硕博连读学生,与深圳华大基因研究院等一大批高水平科研院所和高端企业建立战略合作伙伴关系,联合培养拔尖创新人才。